时间:01-18人气:26作者:柠檬乖乖
引物设计主要依据DNA序列的特异性。引物长度通常在18到22个碱基之间,GC含量保持在40%到60之间。引物3'端必须与模板链严格配对,避免出现连续G或C。引物之间不能有互补序列,防止二聚化形成。设计时还需考虑退火温度,一般比Tm值低5左右。引物长度和GC比例共同影响结合稳定性。
引物设计的关键因素
引物设计需避开重复序列和二级结构区域。引物长度过长会导致特异性下降,过短则容易非特异性结合。引物3'端最后3个碱基的配对至关重要,直接影响延伸效率。引物自身不能形成发夹结构,长度不超过4个碱基。设计工具会自动检查这些参数,确保引物能准确结合目标位点。引物长度和GC比例需要平衡,避免过高或过低。
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