基因重叠率和相似度一样吗?

基因重叠率和相似度不一样。重叠率指两个基因序列共享相同碱基的比例，相似度则是序列整体匹配程度的综合评价，包括位置和内容。

区别

基因重叠率：计算两个基因序列中完全相同的碱基数量占总长度的比例。比如一段100个碱基的基因，与另一段有30个碱基相同，重叠率就是30。这个数值只反映直接匹配的部分，不考虑序列排列顺序或碱基类型。

基因相似度：更全面评估序列的接近程度，不仅看相同碱基数量，还考虑位置差异和替换情况。比如两个基因有80%碱基相同，但位置不同，相似度会低于重叠率。相似度常用于进化分析，判断物种亲缘关系。