转录组数据和芯片数据区别是什么?

转录组数据是通过高通量测序技术直接测量细胞中所有RNA分子的表达量，覆盖范围广，能检测未知转录本。芯片数据则是基于预先设计的探针杂交技术，只能检测已知基因的表达，覆盖范围有限。

区别

转录组数据：采用测序技术，一次性获取全转录本信息，包括可变剪接、非编码RNA等。数据量庞大，分析流程复杂，成本较高，适合发现新转录本和研究复杂调控机制。

芯片数据：依赖固定探针，只能检测预设的基因或转录本。数据量较小，分析流程简单，成本较低，适合大规模样本的已知基因表达差异研究。