gse是什么数据库?

gse是美国国立生物技术信息中心（ncbi）旗下的基因表达综合数据库。它存储了全球科研人员提交的高通量基因表达数据，包括芯片测序和rna-seq结果。研究人员可以通过gse获取不同疾病、组织或实验条件下的基因表达谱数据。数据以样本、平台和系列三个层级组织，方便用户查询和分析。截至2023年，gse已收录超过30万条实验记录，涵盖动植物、微生物等多个物种。

gse的数据特点

gse数据标准化程度高，每条记录包含详细的实验设计、样本信息和原始数据。用户可以通过geoquery工具批量下载数据，支持r、python等编程语言分析。数据库提供在线可视化工具，可直接查看基因表达热图和散点图。数据更新频率为每月1次，新提交数据需经过审核才能入库。gse还提供数据转换服务，可将原始信号值转换为标准化的表达量值。